بدأ أوين مسيرته مع نادي ليفربول الإنجليزي في عام 1996، وقد لعب معهم حتى عام 2004، وقد شارك في تلك الفترة في 216 مباراة وسجل 118 هدف، وفي موسم 2004/2005 انتقل إلى نادي ريال مدريد الإسباني، ولعب معهم 35 مباراة وسجل 13 هدف، وفي عام 2005 انتقل إلى نادي نيوكاسل يونايتد، ولكن بعد انتهاء موسم 2008/2009 وهبوط نيوكاسل يونايتد إلى الدرجة الثانية في الدوري الإنجليزي لم يجدد النادي عقد أوين فأصبح اللاعب حراً ثم تقاعد معه مانشيستر يونايتد بصفقة انتقال حر (بتاريخ 3 يوليو 2009) لأن السير أليكس فيرغسون أراد أن يغطي الفراغ الذي تركه رحيل كل من كريستيانو رونالدو المنتقل إلى ريال مدريد. كارلوس تيفيز المنتقل إلى مانشستر سيتي.